Laboratório Multiusuário de Sequenciamento de DNA e Bioinformática - LASEQ
Laboratório Multiusuário de Sequenciamento de DNA e Bioinformática - LASEQ
O Laboratório Multiusuário de Sequenciamento de DNA e Bioinformática (LASEQ/UFLA) é um centro de excelência dedicado à pesquisa e desenvolvimento nas áreas de genômica, transcriptômica e bioinformática. Localizado na Universidade Federal de Lavras (UFLA), o LASEQ/UFLA oferece uma infraestrutura robusta e diversificada, equipada com tecnologias de ponta para atender às demandas de pesquisa mais exigentes.
Nosso principal objetivo é fornecer infraestrutura avançada e expertise técnica para apoiar estudos genômicos e transcriptômicos, abrangendo uma ampla gama de aplicações, desde a análise de comunidades microbianas até estudos detalhados de genomas e transcriptomas. Para isso, o laboratório conta com cinco plataformas de sequenciamento massivo de DNA: um Ion Proton (ThermoFisher) com capacidade para sequenciar até 80 milhões de reads, dois PGM Ion Torrent (ThermoFisher) capazes de sequenciar até 5 milhões de reads cada, e dois MinIons (Oxford Nanopore) com capacidade de gerar até 48 Gb de dados por corrida.
Para a análise dos dados gerados, o LASEQ/UFLA dispõe de três servidores computacionais de alta performance: um servidor com 12 cores, 64 Gb de memória RAM e 20 Tb de capacidade de armazenamento; outro com 24 cores, 192 Gb de memória RAM e 27 Tb de capacidade de armazenamento; e um terceiro com 20 cores, 256 Gb de memória RAM e 15 Tb de capacidade de armazenamento. Esses recursos garantem uma análise eficiente e precisa dos dados, possibilitando resultados de alta qualidade.
Além das plataformas de sequenciamento e servidores de processamento, o laboratório está equipado com todos os instrumentos necessários para a extração, purificação e avaliação da qualidade e quantidade de biomoléculas (DNA/RNA). Isso inclui sistemas de eletroforese convencional e de alto desempenho, como o Bioanalyzer, tecnologias modernas de fotodocumentação e análise de géis de eletroforese, como o sistema IBright da ThermoFisher, além de outros equipamentos essenciais como termocicladores, balanças, pHmetros, forno de microondas, sistema de fragmentação de DNA Covaris, centrífugas e todo o aparato necessário para a preparação de bibliotecas para sequenciamento.
Nossa equipe está empenhada em incentivar a pesquisa e a colaboração interdisciplinar, proporcionando um ambiente propício à troca de conhecimento e à realização de estudos inovadores na comunidade acadêmica.
O Laboratório Multiusuário de Sequenciamento de DNA e Bioinformática (LASEQ/UFLA) está comprometido em contribuir para o avanço científico nas áreas de genômica e transcriptômica, oferecendo suporte técnico e infraestrutura de ponta para a realização de pesquisas de alta relevância.
O Laboratório Multiusuário de Sequenciamento de DNA e Bioinformática (LASEQ/UFLA) está cadastrado na Plataforma Nacional de Infraestrutura de Pesquisa MCTI –PNIPE.
Equipamentos:
Agilent 2100 Bioanalyzer (Eletroforese de alto desempenho)
2 PGMs IonTorrent (Plataforma de sequenciamento de DNA)
Sistema COVARIS de fragmentação de DNA
Ion Proton (Plataforma de sequenciamento de DNA)
MinIon / Oxford Nanopore (Plataforma de Sequenciamento de DNA)
Fotodocumentador / Transluminador para visualização de géis de eletroforese
Termocicladores
Coordenação:
▪ Prof. Victor Satler Pylro – Coordenador
(35) 3829-5176
E-mail: Este endereço de email está sendo protegido de spambots. Você precisa do JavaScript ativado para vê-lo.
▪ Profa. Fátima Maria de Souza Moreira – Coordenadora Adjunta
(35) 3829-1254
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